El Plan de Acción Trienal, como instrumento de planificación ambiental está conformado por cinco (5) capítulos: el primero de ellos el Marco General contiene el Diagnóstico Ambiental del departamento, la normatividad ambiental, la política y compromisos internacionales, la interrelación con los planes de desarrollo nacional, departamental, municipal, la ordenación de las cuencas, y la articulación con el Plan de Gestión Ambiental Regional PGAR 2003-2012.
En el segundo capítulo encontramos la Síntesis Ambiental del Departamento con la descripción del problema, las causas, localización, identificación de actores, la tendencia del problema y la gobernabilidad. En el tercer capítulo, las Acciones Operativas con los programas y proyectos, la relación con las líneas estratégicas del PGAR y la relación con los objetivos de desarrollo sostenible. El Capítulo Cuarto, contiene el Plan Financiero para los años 2007- 2009, la proyección de ingresos por fuentes, y la proyección de gastos por funcionamiento, servicio de la deuda e inversión debidamente desagregada, los gastos de inversión presentan las asignaciones de los recursos por programas y proyectos; Adicionalmente para la articulación de las acciones y los recursos destinados a la gestión, se identifican las posibles fuentes de financiación nacionales, internacionales y regionales para desarrollar estrategias a través de alianzas. Y en el Capítulo Quinto, el Seguimiento y Evaluación del PAT, el cual establece los mecanismos de seguimiento y evaluación soportados en la necesidad de incrementar la eficiencia en la inversión corporativa, elevar los niveles de impacto de la gestión y en el reconocimiento del papel de los ciudadanos como beneficiarios y actores interesados en la gestión de la corporación.